Con el fin de apoyar el trabajo de la comisión, en la reunión plenaria de fecha 15 de octubre de 2009, se acordó la creación de dos Grupos de Trabajo, con la siguiente conformación:

Grupo de Trabajo Cuenca de Burgos

Dip. Alfredo Javier Rodríguez Dávila
Dip. Eduardo Alonso Bailey Elizondo
Dip. Ramón Jiménez López

Grupo de Trabajo Paleocanal de Chicontepec

Dip. Genaro Mejía de la Merced (COORD.)
Dip. Miguel Martín López
Dip. José Luis Velasco Lino
Dip. Sergio Lorenzo Quiroz Cruz
Dip. Jorge Alberto Juraidini Rumilla